Bei FTP vs. SFTP kommt es auf die Anforderungen an den Datentransfer an: FTP ist für Übertragungen von Daten geeignet, die nicht vor unbefugtem Zugriff geschützt werden müssen. Dies können beispielsweise öffentlich zugängliche Dokumente oder freigegebene Software-Pakete sein. Außerdem reicht FTP für die Übermittlung in lokalen, privaten Netzwerken aus, solange diese ausreichend gesichert sind.
Müssen hingegen vertrauliche Informationen zwischen Server und Client ausgetauscht werden, sollte SFTP verwendet werden. Dadurch ist es möglich, sensible Daten auch in öffentlichen Netzwerken sicher und verschlüsselt zu übertragen. Darunter fallen beispielsweise personenbezogene Daten wie Finanzinformationen, Gesundheits- oder Anmeldedaten. Ebenso empfiehlt es sich, SFTP zwischen verschiedenen Zweigstellen eines Unternehmens zu benutzen.